La Rete effettua approfondimenti su problematiche connesse alla componente ambientale dei settori interessati dai Fondi Strutturali mediante la costituzione di specifici Gruppi di Lavoro.

I Gruppi si distinguono in Gruppi di Lavoro (GdL) e Gruppi di Lavoro Obiettivo (GLO) e affrontano rispettivamente tematiche metodologiche e settoriali; hanno una composizione definita e un mandato annuale esplicito che ne individua obiettivi, tempi e prodotti attesi.

Partecipano ai lavori tutti i rappresentanti delle istituzioni interessate, su base volontaria. I Gruppi espongono i risultati delle loro indagini in occasione delle riunioni plenarie della Rete la quale, previa approvazione, li presenta al (il seguente collegamento apre un sito esterno) Comitato di Sorveglianza del Quadro Comunitario di sostegno (QCS).

Attualmente risultano in attività 9 Gruppi di Lavoro:

• Acqua
• Bonifica dei siti inquinati
• Energia
• Imprese e ambiente nei RAITA
• Monitoraggio ambientale
• Principio "chi inquina paga"
• Rete ecologica
• Rifiuti
• Sviluppo rurale

Nell'anno 2006 l'attività della Rete assume maggiore flessibilità per contribuire all'individuazione di strategie per il prossimo ciclo di (il seguente collegamento apre un sito esterno) programmazione 2007-2013.
Punto di partenza sono i dati di attuazione finanziaria del (il seguente collegamento apre un sito esterno) QCS e dei (il seguente collegamento apre un sito esterno) DOCUP che disegnano una situazione molto diversificata per area territoriale e per settore. L'attività operativa dei Gruppi di Lavoro della Rete è basata sui principi di:

• continuità - nell'attività di analisi e approfondimento dei settori a finalità ambientale del QCS
• flessibilità - per tenere conto dell'evoluzione del contesto della legislazione comunitaria e nazionale e della programmazione settoriale
• cooperazione interistituzionale - anche attraverso modelli e strumenti di partecipazione idonei a favorire il più ampio coinvolgimento dei soggetti istituzionali responsabili
• integrazione tra politiche a finalità ambientale - in modo che si consolidi un percorso di graduale superamento dell'approccio settoriale delle tematiche ambientali

Compito della Rete è anche la diffusione di buone pratiche in campo ambientale. I casi di eccellenza vengono segnalati dalle Regioni e veicolati in sede di riunione plenaria.
La Rete effettua studi ed indagini che contribuiscono all'analisi di contesto e che spesso diventano punto di partenza per gli ulteriori approfondimenti dei Gruppi di Lavoro.